The Depths to trzecie środowisko, które może napotkac gracz. Wygląda jak zbiór jaskiń zaśmieconych kośćmi.
W The Depths można spotkać następujące potwory:
Baby
Boil
Boom Fly
Brain
Globin
Guts
Hive
Host
Knight
Leaper
Leech
Mr. Maw
Moter
Pooter
Vis
Keeper
